Las Secretaría de Centros Universitarios y Unidades Académicas Profesionales, tienen como objetivo coordinar y supervisar el desempeño conjunto de los espacios académicos a través de la implementación de acciones y estrategias de corto, mediano y largo plazo mediante la conjugación de sus recursos y potencialidades con los correspondientes a las Dependencias de Administración Central.

Entre sus principales funciones se encuentran el dirigir y coordinar la participación de los Centros Universitarios y las Unidades Académicas en la planeación académica, apoyando la interacción de estos, así como supervisar el apoyo a los procesos de seguimiento y evaluación de las metas y resultados con la finalidad de retroalimentar las acciones institucionales y posibilitar la rendición de cuentas.

Cabe resaltar que, esta instancia es la encargada de atender las solicitudes de apoyo por parte de los espacios académicos desconcentrados ante las instancias de la Administración Central con la finalidad de facilitar la interacción de los espacios, coordinando en todo momento reuniones de trabajo que permitan concretar la implementación de propuestas que favorezcan la solución de requerimientos y necesidades comunes